More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4627 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  54.32 
 
 		 285 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  52.52 
 
 		 285 aa  291  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  52 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.49 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.05 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  41.13 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  38.87 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  38.87 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  40.15 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  37.99 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  38.36 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  37.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  37.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  37.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  37.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  37.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  37.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 283 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  37.99 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  39.21 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  34.91 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.02 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  32.87 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.88 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  40.44 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  32.6 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  22.82 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.91 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.13 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  35.14 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  31.69 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1468  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0894  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.91 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>