More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4043 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  100 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  94.68 
 
 		 282 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  81.21 
 
 		 282 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  81.21 
 
 		 282 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  81.21 
 
 		 282 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  77.94 
 
 		 282 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  78.01 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  68.79 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  65.11 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  65.11 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  65.11 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  65.11 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  65.11 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  64.75 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  63.04 
 
 		 281 aa  325  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  62.45 
 
 		 305 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  52.16 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  55.76 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  51.48 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  42.09 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  40.29 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.08 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.29 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  40.29 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  38.99 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.71 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  41.99 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.93 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  30.59 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  40.14 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  39.15 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  36.86 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  35.89 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  38.63 
 
 		 259 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  27.67 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.65 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 526 aa  72.4  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.37 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  31.64 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.11 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  21.27 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  40 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.5 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.97 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 581 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  23.88 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  26.24 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.92 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.69 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.18 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>