More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6582 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  59.07 
 
 
255 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  44.53 
 
 
283 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.23 
 
 
285 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
288 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  34.73 
 
 
290 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  35.93 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  36.36 
 
 
275 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
240 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  33.46 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.39 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  37.02 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  39.43 
 
 
280 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  35.93 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  32.36 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  36.91 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  36 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  38.22 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.09 
 
 
290 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.44 
 
 
282 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
282 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
282 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
287 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 
287 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
282 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
275 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
282 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  36.82 
 
 
285 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  35.5 
 
 
282 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.12 
 
 
291 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  45.97 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  35.26 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  40.62 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  40.62 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  40.62 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  40.62 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  40.62 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  40 
 
 
291 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  44.52 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  34.94 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.01 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.11 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  35.62 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  40.37 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  41.04 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  43.83 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.22 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.67 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
272 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.77 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
415 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.74 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.54 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.84 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.48 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.44 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.54 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  46.15 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.9 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>