More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1870 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  100 
 
 		 219 aa  458  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2678  hypothetical protein  55.06 
 
 		 117 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  45.36 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.56 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  32.5 
 
 		 658 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.37 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.8 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.11 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  36.23 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 269 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 331 aa  68.2  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2558  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.9 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.57 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.512948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.03 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.39 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.38 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.8 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  42.27 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.11 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  40 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.41 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.34 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.77 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.53 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 261 aa  62  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.35 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.33 
 
 		 256 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.4 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.52 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  41.33 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  29.24 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>