More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5646 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  100 
 
 
277 aa  564  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  74.1 
 
 
277 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  63.94 
 
 
276 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  65.31 
 
 
279 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  63.1 
 
 
279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  62.55 
 
 
270 aa  345  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  63.4 
 
 
270 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  61.51 
 
 
270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  59.21 
 
 
286 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  59.47 
 
 
287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  59.85 
 
 
287 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  59.55 
 
 
286 aa  298  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  42.53 
 
 
273 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.36 
 
 
272 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  41.91 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  39.16 
 
 
275 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  39.16 
 
 
275 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
282 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  36.4 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  39.18 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
266 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  39.51 
 
 
278 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  37.97 
 
 
274 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  37.83 
 
 
283 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  37.83 
 
 
284 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
273 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
274 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
253 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  33.97 
 
 
273 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  32.66 
 
 
250 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  32.66 
 
 
252 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
266 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
269 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  36.91 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.47 
 
 
269 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  34.2 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  44.66 
 
 
581 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  36.3 
 
 
251 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  36.76 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.44 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.22 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.81 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.45 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  41.9 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.69 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.39 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1347  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.75 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.28 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.72 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  43.93 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.07 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.62 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.34 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.62 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.57 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.48 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.83 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.75 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  37.38 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.1 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.48 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2836  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.56 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  32.39 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.51 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.52 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0388  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.23 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.81 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.58 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.07 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.74 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.27 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.79 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.79 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.79 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.74 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>