More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2092 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 		 270 aa  557  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  73.33 
 
 		 270 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  73.33 
 
 		 270 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  63.4 
 
 		 277 aa  345  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  62.59 
 
 		 279 aa  344  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  63.02 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  61.65 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  61.83 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  61.13 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  59.62 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  59.62 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  59.62 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.76 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  41.18 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  42.34 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  42.17 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  42.17 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  39.46 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  41.13 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  44.16 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  39.7 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  40.29 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.8 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  42.58 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  51.18 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  37.83 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.64 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  44.66 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.46 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  40.6 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  36.23 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.1 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.83 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.17 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.83 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.13 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.78 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.9 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.15 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.2 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.07 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.61 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.18 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  42 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.42 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.85 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.16 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.3 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.95 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  37.91 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.64 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.05 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.84 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.33 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.4 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  32.81 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4884  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.62 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.321775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.76 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.93 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3491  Methyltransferase type 11  46 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>