More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0840 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  65.79 
 
 		 271 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  63.67 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  64.04 
 
 		 272 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  61.4 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  59.93 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  59.93 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  56.82 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  57.74 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  52.67 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  47.49 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 526 aa  158  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1935  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.55 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.74 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  32.32 
 
 		 865 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  35.08 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  40.29 
 
 		 825 aa  82  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  31.6 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.67 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.96 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.05 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  34.09 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  47.06 
 
 		 212 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.34 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4919  methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.68 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  42.61 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  37.16 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.02 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  26.6 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  44.55 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  34.21 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  34.21 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  34.21 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  34.21 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  34.21 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  34.21 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 581 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.13 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  34.13 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.13 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.13 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  39.01 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  38.68 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.68 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.09 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.57 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  33.33 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  30.88 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  40 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.82 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.43 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.7 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.31 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.74 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.13 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.26 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.52 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  40 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.15 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.68 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>