More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4060 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  100 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  75.74 
 
 
282 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  75.18 
 
 
284 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  61.99 
 
 
280 aa  310  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  60.89 
 
 
275 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  60.52 
 
 
275 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  60.52 
 
 
275 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  59.18 
 
 
273 aa  288  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  60.22 
 
 
283 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  56.88 
 
 
274 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  47.12 
 
 
274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  51.15 
 
 
274 aa  245  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  52.09 
 
 
266 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  41.04 
 
 
270 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  41.96 
 
 
252 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  41.57 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  41.57 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  40.15 
 
 
277 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
277 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  39.27 
 
 
279 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  39.85 
 
 
270 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  39.92 
 
 
276 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  41.7 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.29 
 
 
270 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  40.07 
 
 
287 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 
287 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.45 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
270 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  40.15 
 
 
286 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  32.72 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  34.66 
 
 
273 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
271 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.2 
 
 
275 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.14 
 
 
269 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  44.83 
 
 
581 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  39.72 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.83 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.83 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  38.97 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  31.7 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.98 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.02 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.98 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  37.29 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  38.13 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  37.39 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.93 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  37.84 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.84 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.62 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.7 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.88 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.38 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.5 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.88 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.2 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.74 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.74 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.88 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2269  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.81 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.32 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2118  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubiE  27.97 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.45 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.45 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.74 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>