More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3929 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  73.61 
 
 		 269 aa  390  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  72.86 
 
 		 269 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  61.94 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  34.47 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 279 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  39.16 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.26 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  34.47 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.06 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  34.43 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  37.64 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  37.78 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  34.89 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 581 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.67 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  34.14 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  29.96 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.81 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.94 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.25 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.15 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.29 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.92 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  33.88 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.79 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.05 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.91 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.13 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.14 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.03 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.32 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  28.84 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.17 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0595  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.11 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.316982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  36.84 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  37.72 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  37.67 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.82 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.23 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.1 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.95 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.96 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>