More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4692 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  73.64 
 
 
261 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.3 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  30.04 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  36.93 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  32.96 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  31.7 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
273 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  29.23 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.31 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.38 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  35.17 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  32.42 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  43.43 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5061  Methyltransferase type 11  47.52 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.35 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.76 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  26.73 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
281 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.01 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  29.53 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  28.04 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  29.53 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  28.04 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
299 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  32.48 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  29.53 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  27.16 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  36 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  29.53 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  29.53 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  29.53 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  29.53 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  29.53 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  28.04 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.98 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  35.66 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
526 aa  59.3  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
249 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 
238 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  28.04 
 
 
251 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.66 
 
 
282 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  30.97 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>