More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3502 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  100 
 
 
225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  41.14 
 
 
265 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.67 
 
 
230 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.95 
 
 
225 aa  131  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
223 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  42.4 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
273 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  38.04 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  37.42 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
268 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  37.43 
 
 
262 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  35.32 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.88 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  36.53 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  35.98 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  40.91 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  42.55 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  33.78 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  35.26 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  39.09 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  31.41 
 
 
331 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  36.3 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.63 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  38.89 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  33.9 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  33.9 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  31.61 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  41.28 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.54 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.66 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.25 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.21 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  33.05 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  36.44 
 
 
251 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  36.44 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  40 
 
 
269 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  41.96 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  40 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  35.21 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.47 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  42 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  41.53 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.72 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.94 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.56 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  42 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  38.85 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.17 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  33.05 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  43 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  33.05 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  35.2 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  36.63 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  26.73 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  40.68 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  31.03 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  32.73 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>