More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0355 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  100 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 
241 aa  125  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
262 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
268 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  37.61 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
221 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  40.72 
 
 
225 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
225 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  39.13 
 
 
216 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.97 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  39.83 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.23 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  43.68 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  42.15 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
213 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  42.39 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  43.27 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  43.02 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  43.43 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  40.45 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.55 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  42.22 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  42.22 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  43.62 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.81 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  39.08 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.46 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  44.33 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.08 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  41.11 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.38 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  43.7 
 
 
239 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
208 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
194 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  35 
 
 
212 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  33.71 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.43 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  43.01 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  33.71 
 
 
236 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  33.71 
 
 
236 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
210 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.77 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  33.71 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  33.71 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 
244 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
212 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  41.41 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.44 
 
 
263 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  33.71 
 
 
199 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  36.55 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  33.71 
 
 
209 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
211 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  44.21 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  32.22 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  44.21 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  40.59 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  35.92 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>