More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2127 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  100 
 
 
229 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  40 
 
 
215 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  39.52 
 
 
210 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  38.27 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  41.71 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  36.68 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  40.83 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.14 
 
 
503 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  35.47 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
207 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  38.73 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  39.77 
 
 
218 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
204 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  36.16 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
203 aa  101  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0256  methlytransferase  33.73 
 
 
200 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272291  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
265 aa  95.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  37.02 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
204 aa  92  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
235 aa  85.1  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.14 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1031  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  31.94 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  31.95 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.22 
 
 
345 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0764  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
199 aa  62.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.855881  decreased coverage  0.00371896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  37.17 
 
 
261 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
261 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  31.34 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
216 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
273 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  32 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.11 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
310 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  32.47 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.42 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
624 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.81 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  30.64 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
281 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.39 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.65 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
196 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  31.38 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.83 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
283 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  53.33 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.62 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  36.84 
 
 
658 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.89 
 
 
199 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  29.01 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.57 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  41.05 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.89 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>