More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0849 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  84.84 
 
 
281 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  69.42 
 
 
282 aa  322  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  48.34 
 
 
279 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.75 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.88 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.48 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.94 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.96 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.21 
 
 
238 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.83 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.37 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.88 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.6 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.4 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  31.9 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.17 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.92 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  35.92 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  37.12 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.88 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.08 
 
 
279 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.88 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0575  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.17 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
357 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.26 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.51 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  38.18 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.16 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.75 
 
 
277 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.95 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.34 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  35.67 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.01 
 
 
248 aa  62.4  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
1106 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.98 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.01 
 
 
248 aa  62.4  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.85 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.88 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.16 
 
 
232 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.85 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.88 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2304  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000612438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
581 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  28.8 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.4 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  38.18 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0958  Methyltransferase type 11  35 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.67 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  39.37 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>