More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3197 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  100 
 
 		 247 aa  518  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  35.78 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.74 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.49 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  28.3 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.3 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  28.3 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  28.3 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  28.3 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  28.3 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  26.07 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.57 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  25.99 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  29.2 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.67 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  28.24 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.88 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  29.17 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  29.17 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  22.51 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  25.71 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  25.71 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  25.71 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  25.71 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  25.71 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  25.71 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  25.71 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.71 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.45 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  28.94 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.45 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  29.92 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.26 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  27 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  24.17 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.34 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.35 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.42 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  25.23 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.36 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  25 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.25 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.78 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  28.28 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.22 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>