More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1001 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  54.87 
 
 		 285 aa  309  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  50.92 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  42.81 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  45.32 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  42.03 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  41.91 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.39 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.14 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  32.84 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  27.6 
 
 		 330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  25.4 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  37.76 
 
 		 672 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  29.48 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 309 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.24 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 214 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 332 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.11 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.37 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.52 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  23.36 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  31.25 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.73 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  34.04 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.22 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  29.74 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  27.98 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  33.9 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2221  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 1177 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 1177 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  37.74 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  26.95 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  28.15 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  23.87 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  32.86 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  25.82 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 1037 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  25.6 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  25.6 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.22 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  35.35 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  26.21 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.08 
 
 		 230 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  26.36 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.04 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 625 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  27.5 
 
 		 876 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  22.28 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  28.29 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  33.55 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.25 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>