More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3053 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  100 
 
 
332 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  30 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  30.65 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  34.16 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.88 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  27.34 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  30.19 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  31.94 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.11 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  37.68 
 
 
313 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  35.14 
 
 
358 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.89 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  34.21 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.38 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 
273 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
282 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
314 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  32.1 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  27.43 
 
 
306 aa  86.7  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.67 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.15 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  27.66 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  30.13 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  32.21 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.88 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  33.8 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  32.28 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  32.54 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.07 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  27.22 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  31.79 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  31.79 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  31.79 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  31.79 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  32.45 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  31.79 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  31.13 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  32.45 
 
 
229 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  31.47 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.12 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.25 
 
 
672 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  30.46 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.13 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.61 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  31.29 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
1523 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  29.14 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  29.14 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  28.32 
 
 
228 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
1523 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.83 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  29.17 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  30.46 
 
 
199 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  23.51 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  28.32 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.66 
 
 
240 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.87 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.92 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
996 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  29.12 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  23.92 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 
457 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
572 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 
246 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
457 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  27.49 
 
 
1046 aa  59.7  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 
746 aa  59.7  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.33 
 
 
265 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  26.25 
 
 
195 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.48 
 
 
253 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
194 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 
415 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>