171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0836 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  100 
 
 
310 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  65.59 
 
 
311 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  43.87 
 
 
314 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  41.85 
 
 
316 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  41.35 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  39.34 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  37.81 
 
 
330 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 
300 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  30.49 
 
 
306 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  32.13 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  30.27 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  29.14 
 
 
285 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.39 
 
 
282 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
330 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
303 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
317 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  29.12 
 
 
342 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.95 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.62 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.86 
 
 
672 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  27.48 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  32.21 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  25.94 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  28.46 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  30.41 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.97 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.99 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  23.7 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  22.07 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  25.48 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.47 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
1037 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  23.4 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.17 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  24.73 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  31.06 
 
 
187 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  31.06 
 
 
187 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  21.67 
 
 
236 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  30.3 
 
 
187 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24.47 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
625 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
383 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
1312 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  24.6 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  23.64 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  23.98 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  24.04 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  34.07 
 
 
613 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
1314 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  28.57 
 
 
413 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  24.38 
 
 
353 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
996 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  28.41 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  21.38 
 
 
572 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  32.94 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 
1340 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
1162 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  28.41 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  23.77 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
1177 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
1177 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  24.84 
 
 
215 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  31.06 
 
 
244 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  24.39 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.53 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
1523 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.14 
 
 
253 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
182 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  21.97 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  25.24 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
1094 aa  49.3  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  28.03 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  27.7 
 
 
379 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  26.19 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  25.23 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  28.85 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  22.8 
 
 
607 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  27.81 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  23.31 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>