125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0838 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 316 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  45.25 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  44.3 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  42.72 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  41.72 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  41.85 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  37.25 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  28.16 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.39 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  31.56 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  30.38 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 		 358 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.34 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  31.66 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.01 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.3 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26.42 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  27.75 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.19 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.34 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  31.29 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  24.5 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.33 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  22.69 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.75 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.14 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.38 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24 
 
 		 672 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  25.48 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 1340 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  25.3 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  25.3 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.38 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  26.94 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  24.11 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  22.7 
 
 		 341 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 996 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  24.34 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.42 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  24.6 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 1314 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 572 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1177 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1177 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 581 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 1523 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 		 253 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43688  predicted protein  28.99 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  22.47 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  18.67 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 194 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 		 1523 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  27.33 
 
 		 574 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  20.16 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  28.57 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  26.53 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  28.19 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24.42 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 457 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  28.16 
 
 		 229 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  29.13 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.41 
 
 		 248 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.27 
 
 		 253 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  22.58 
 
 		 607 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 		 383 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.7 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  29.81 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.89 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.84 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  29.57 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  29.66 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  29.73 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>