More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1775 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  100 
 
 
298 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  38.11 
 
 
303 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  36.46 
 
 
303 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  34.23 
 
 
305 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  32.13 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  31.96 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
382 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.73 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  37.67 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.09 
 
 
672 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  29.93 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  31.72 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.74 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  30.41 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  29.8 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  26.12 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28.5 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  25.15 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  31.64 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.42 
 
 
214 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  30.99 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.76 
 
 
353 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
353 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  29.33 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  28.32 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  30.14 
 
 
358 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  32.21 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  29.59 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  32.19 
 
 
217 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.18 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  25.75 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
1523 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
335 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  22.07 
 
 
447 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  22.07 
 
 
447 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.4 
 
 
345 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  27.14 
 
 
323 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  23.6 
 
 
415 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
194 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.47 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  28.19 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  25.81 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  25.95 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  26.45 
 
 
229 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  25.81 
 
 
229 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  25.64 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  29.68 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.27 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  25.81 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  25.81 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  28.12 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  25.81 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  25.81 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  34.67 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.87 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  24.38 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  24.68 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.46 
 
 
391 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  23.97 
 
 
402 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.31 
 
 
236 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.3 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  21.64 
 
 
400 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  21.64 
 
 
400 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  27.53 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  22.37 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 
230 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  25.66 
 
 
199 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  35.78 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  31.51 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
314 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 
263 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  22.9 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 
241 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.77 
 
 
414 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 
238 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>