More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0420 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  100 
 
 
335 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.94 
 
 
345 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.39 
 
 
353 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 
353 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.62 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  31.17 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
310 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  28.69 
 
 
342 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.13 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  34.87 
 
 
214 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.61 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.05 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.27 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.61 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  24.71 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.11 
 
 
240 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  27.05 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  27.3 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  27.69 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  27.87 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.93 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.57 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.7 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.57 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  31.79 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.07 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  24.83 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  32.47 
 
 
543 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
1046 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.89 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.11 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  27.18 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
279 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  25 
 
 
625 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  27.11 
 
 
229 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  32.88 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  26.51 
 
 
229 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.27 
 
 
415 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
222 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  25.44 
 
 
229 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.27 
 
 
244 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.87 
 
 
215 aa  63.2  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.4 
 
 
298 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
282 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  26.04 
 
 
229 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  29.63 
 
 
330 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
247 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
1037 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  25.44 
 
 
229 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  26.51 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  23.95 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  24.85 
 
 
229 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  24.85 
 
 
229 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  29.22 
 
 
199 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  24.85 
 
 
229 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  24.85 
 
 
229 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  23.24 
 
 
447 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  23.24 
 
 
447 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  27.53 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
247 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  29.03 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
1162 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
1523 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2882  hypothetical protein  29.41 
 
 
223 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.28 
 
 
305 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
1314 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  24.36 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.7 
 
 
247 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  24.67 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
266 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  22.94 
 
 
251 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  26.17 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.49 
 
 
251 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>