260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1903 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  778    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  39.91 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  40.8 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  38.12 
 
 		 477 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  40.91 
 
 		 272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  41.01 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  42.86 
 
 		 1635 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  36.87 
 
 		 442 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  42.2 
 
 		 646 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  30.77 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  37.43 
 
 		 1085 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.69 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.38 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  30.07 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  25.83 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 214 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  28.73 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  28.26 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  28.98 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  28.18 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  26.58 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  28.18 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  26.58 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  28.18 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  35.35 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  24.48 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.65 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0305  hypothetical protein  28.1 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.23 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.51 
 
 		 200 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1094 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 263 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  27.14 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 1106 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  27.88 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  27.54 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 706 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 214 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.7 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 710 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 242 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.81 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  23.47 
 
 		 233 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  24.87 
 
 		 307 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  24.49 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 269 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 249 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 218 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 		 300 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 261 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  28.06 
 
 		 870 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.39 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  33.96 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0299  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.65 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>