More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0971 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  100 
 
 		 330 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  45.34 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.64 
 
 		 358 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  32.42 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  27.3 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  30.51 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  30.74 
 
 		 353 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  30.74 
 
 		 353 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  32.65 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 282 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.23 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  30.3 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  33.48 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  29.29 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.04 
 
 		 345 aa  99.4  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.32 
 
 		 672 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.71 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.12 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 306 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  25.12 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 281 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  21.14 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  29.11 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.75 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  29.09 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.23 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  20.63 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  28.37 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 1046 aa  75.9  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  35.17 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  28 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  28 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.7 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 572 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  28.86 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.72 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  23.29 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  23.83 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  35.62 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  27.5 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.35 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.59 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 1177 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 1177 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.97 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  19.63 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  19.63 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  20.08 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  26.56 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.61 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.18 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.63 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  29.17 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  29.17 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  29.17 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  29.17 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  29.17 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  29.17 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.18 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.97 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.21 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  22.77 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  26.42 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25.83 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  28.18 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.73 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>