105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1917 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  100 
 
 
876 aa  1804    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 
572 aa  144  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.06 
 
 
224 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.9 
 
 
243 aa  97.8  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.7 
 
 
239 aa  90.1  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.41 
 
 
225 aa  87.4  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.97 
 
 
234 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.45 
 
 
611 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  29.91 
 
 
675 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.45 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.97 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.04 
 
 
306 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.07 
 
 
246 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.49 
 
 
241 aa  76.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.7 
 
 
261 aa  73.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.23 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.51 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.97 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  28.45 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.05 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.07 
 
 
288 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  25.47 
 
 
244 aa  65.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  24.89 
 
 
242 aa  64.7  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.02 
 
 
453 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  25.61 
 
 
310 aa  63.9  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.96 
 
 
228 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.16 
 
 
266 aa  63.9  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
286 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.11 
 
 
231 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.83 
 
 
672 aa  62.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.72 
 
 
252 aa  62.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.76 
 
 
246 aa  62  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.27 
 
 
242 aa  62.4  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
267 aa  62  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.73 
 
 
256 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.32 
 
 
212 aa  60.8  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 
317 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.32 
 
 
234 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 
305 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  21.83 
 
 
277 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
322 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
282 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  25 
 
 
281 aa  57.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.63 
 
 
332 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  22.26 
 
 
611 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  20.41 
 
 
358 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  23.28 
 
 
682 aa  55.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.5 
 
 
235 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  21.83 
 
 
318 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  22.95 
 
 
353 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  22.95 
 
 
353 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.52 
 
 
241 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.15 
 
 
250 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.82 
 
 
305 aa  52.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  20.91 
 
 
346 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.85 
 
 
310 aa  52.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  21.72 
 
 
303 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0209  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  34.38 
 
 
259 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.22 
 
 
291 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.21 
 
 
336 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  22.61 
 
 
240 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  21.67 
 
 
275 aa  50.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  22.62 
 
 
330 aa  49.3  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  21.47 
 
 
345 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  20.72 
 
 
300 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  20.13 
 
 
306 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  21.68 
 
 
308 aa  48.9  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.03 
 
 
241 aa  49.3  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.27 
 
 
298 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  22.97 
 
 
324 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
281 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  24.41 
 
 
246 aa  48.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2840  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
259 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
634 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14261  hypothetical protein  27.63 
 
 
240 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  28.26 
 
 
408 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
1106 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0141  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.74 
 
 
239 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00561712  normal  0.0137195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0180  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.74 
 
 
259 aa  46.2  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.532652  normal  0.0569453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
283 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1053  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  50 
 
 
248 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.164178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
210 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 
237 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  29.17 
 
 
241 aa  45.8  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
711 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0740  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  45.83 
 
 
263 aa  45.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0749  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
263 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.304533  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  23.24 
 
 
457 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2595  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
263 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0944076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  22.56 
 
 
354 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.11 
 
 
258 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5878  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
261 aa  44.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2465  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
263 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1935  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
263 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2547  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
263 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2571  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
263 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.326733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.77 
 
 
228 aa  44.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28 
 
 
273 aa  44.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  21.78 
 
 
287 aa  44.3  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25531  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  38.96 
 
 
271 aa  44.3  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>