More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1513 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 317 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  38.57 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.97 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 267 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.12 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  23.92 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  37.67 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.71 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  32.28 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  29.29 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 996 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.48 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.95 
 
 		 672 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  27.19 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  29.84 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  33.8 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 		 1523 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  25.97 
 
 		 447 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  25.97 
 
 		 447 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  26.7 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  26.43 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  35.14 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  24.38 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  23.17 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.52 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  26.53 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  30.52 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  26.53 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  26.53 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  25.43 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  39.86 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  27.81 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  23 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  21.96 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 581 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 		 1162 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  39.86 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  26.45 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  25.13 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  24.73 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  26.32 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26.97 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.58 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  28.36 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  25.88 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.44 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  26.32 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.09 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  25.52 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.47 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  26.81 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  34.23 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  25.83 
 
 		 229 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 		 1523 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  34.23 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  34.23 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  34.23 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>