More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0453 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  57 
 
 
303 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  54.33 
 
 
303 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  57.53 
 
 
310 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  34.29 
 
 
297 aa  185  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  34.23 
 
 
298 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  31.63 
 
 
312 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  29.69 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  31.14 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  22.84 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  30.63 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.23 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.5 
 
 
277 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  29.96 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  25 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  29.95 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.45 
 
 
672 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.04 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.7 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  26.98 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  27.69 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.63 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  28.12 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  28.91 
 
 
1046 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.93 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.27 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.86 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  23.14 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.57 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.69 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  25.46 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.77 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
513 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  30.3 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.99 
 
 
214 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  30.77 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24.77 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  37 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.67 
 
 
215 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
996 aa  63.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.52 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 
383 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 
358 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
572 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
1523 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.65 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  23.78 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  27.22 
 
 
410 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  25.34 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.98 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  24.49 
 
 
407 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  25 
 
 
574 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  26.64 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  25.21 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  25.5 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  24.49 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  26.71 
 
 
413 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25 
 
 
415 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  25.52 
 
 
313 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  23.26 
 
 
447 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  23.26 
 
 
447 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  31 
 
 
400 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  26.54 
 
 
413 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  30.88 
 
 
420 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  26.03 
 
 
373 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  26.54 
 
 
413 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
324 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.64 
 
 
342 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.67 
 
 
335 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  26.26 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  24.17 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.98 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  30 
 
 
607 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  34 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  27.11 
 
 
411 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  23.83 
 
 
409 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
1094 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  25.78 
 
 
236 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 
210 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.64 
 
 
457 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  29.24 
 
 
264 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  24.5 
 
 
410 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>