More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0835 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  50.92 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  49.08 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  42.75 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  40.86 
 
 		 300 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  42.91 
 
 		 298 aa  205  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  38.04 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  32.13 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  32.47 
 
 		 311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  28.07 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 310 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  29.87 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  28.11 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.26 
 
 		 672 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  31.66 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  34.9 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  32.79 
 
 		 332 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 330 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  31.14 
 
 		 305 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.92 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.79 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.2 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  30.29 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  34.93 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  31.38 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  28.05 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  26.75 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  30.99 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  22.54 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  27.83 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 1037 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  26.38 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  30 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.39 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  23.53 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  24.74 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  30.41 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 1523 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.81 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.95 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  26.39 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  26.9 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  27.04 
 
 		 407 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  26.9 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.86 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.85 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  24.68 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  23.35 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.86 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  25.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 607 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.4 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 613 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  25.78 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  22.7 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>