More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0355 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  100 
 
 
342 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.64 
 
 
358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  35.19 
 
 
309 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
303 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
330 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.12 
 
 
310 aa  99.4  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27 
 
 
306 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.89 
 
 
300 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
310 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.13 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.77 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.27 
 
 
317 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.39 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.93 
 
 
672 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  30 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  30.55 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.56 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.05 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  25.1 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.22 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  30.04 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.05 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  29.66 
 
 
625 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  29.21 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  29.46 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  26.02 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
1037 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
1340 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.36 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  24.9 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  25.3 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  29.17 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25.9 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  27.67 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  26.1 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 
607 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.88 
 
 
277 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  25.43 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  22.69 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.62 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  27.78 
 
 
620 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  26.55 
 
 
199 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  19.92 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
226 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.37 
 
 
237 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 
239 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.93 
 
 
238 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.64 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.96 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  31.37 
 
 
457 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  24.56 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.64 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 
217 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
235 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.78 
 
 
235 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.85 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  23.08 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  30.17 
 
 
215 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.99 
 
 
239 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  20.55 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.96 
 
 
326 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  23.94 
 
 
240 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.8 
 
 
332 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.95 
 
 
232 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  32 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.12 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.14 
 
 
241 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
241 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.58 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  30.63 
 
 
242 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.63 
 
 
382 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
196 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 
217 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
243 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 
245 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
260 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 
249 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
231 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  32 
 
 
207 aa  53.1  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.29 
 
 
241 aa  53.1  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.54 
 
 
253 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  19.52 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
1523 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 
229 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>