More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3058 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  100 
 
 		 318 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  45.34 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  33.23 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  36.93 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 353 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.92 
 
 		 353 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.3 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.89 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.13 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.9 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  30.84 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  31.56 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  28.23 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  29.95 
 
 		 281 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  27.32 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.28 
 
 		 672 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  29.71 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.06 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.83 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  28.33 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  30.73 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  23.05 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 214 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  28.67 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  22.81 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  30.77 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.78 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  27.2 
 
 		 625 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  26.04 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  27.95 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  25.7 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  25.51 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  28.39 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  22.43 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.75 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  37.14 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5630  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.502531  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.75 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1162 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  25.88 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  31.47 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  23.5 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  21.83 
 
 		 876 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  32.14 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 710 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 1046 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  26.87 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  35.25 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  34.43 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>