More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1324 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  59.58 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 353 aa  85.9  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.55 
 
 		 353 aa  85.9  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 326 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 326 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.27 
 
 		 277 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.73 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.27 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.58 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.47 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  23.61 
 
 		 303 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.7 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.94 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  23.67 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.13 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  20.23 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  24.51 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.67 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.94 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  27.47 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.47 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.58 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.83 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.25 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.65 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  20.7 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  28.96 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.47 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  24.65 
 
 		 305 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.52 
 
 		 672 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1209  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  18.41 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  23.21 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862077  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  24.87 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.04 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.41 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  24.18 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 1523 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.83 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  21.01 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.59 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  22.51 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.41 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.29 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.84 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.19 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  26.01 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.66 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.8 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  23.84 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  24.87 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  24.65 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  21.12 
 
 		 572 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3209  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  27.81 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 1046 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2960  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  28.06 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0386  hypothetical protein  21.3 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.669351  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 		 711 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.65 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  26.51 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  30.48 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>