151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1350 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  100 
 
 
1046 aa  1969    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  31.5 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.88 
 
 
345 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  33.93 
 
 
353 aa  73.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
353 aa  73.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  35.67 
 
 
275 aa  73.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.91 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 
457 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.27 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  28.74 
 
 
240 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  30.08 
 
 
406 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
306 aa  63.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  33.87 
 
 
287 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  40.4 
 
 
281 aa  62.4  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  26.61 
 
 
306 aa  62  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.18 
 
 
358 aa  61.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  24.46 
 
 
346 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  29.86 
 
 
303 aa  60.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.49 
 
 
332 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  33.64 
 
 
383 aa  60.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
300 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.21 
 
 
672 aa  59.7  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
291 aa  59.7  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.71 
 
 
244 aa  59.7  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  31.69 
 
 
274 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
317 aa  59.3  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.17 
 
 
297 aa  58.9  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
214 aa  58.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
222 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  32.67 
 
 
308 aa  58.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.59 
 
 
382 aa  58.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
1177 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
1177 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
513 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  26.58 
 
 
396 aa  55.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 
318 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
248 aa  55.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.53 
 
 
572 aa  55.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 
318 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.98 
 
 
273 aa  55.1  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  30.82 
 
 
318 aa  55.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  27.53 
 
 
239 aa  54.3  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.22 
 
 
277 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  31.11 
 
 
264 aa  53.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.34 
 
 
272 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 
222 aa  52.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
210 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.38 
 
 
394 aa  53.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.28 
 
 
336 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  24.9 
 
 
298 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
237 aa  52  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  28.39 
 
 
308 aa  51.2  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
263 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  29.61 
 
 
223 aa  51.6  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  30.67 
 
 
344 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  29.68 
 
 
312 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
261 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
274 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
214 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1958  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.09 
 
 
406 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2569  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.09 
 
 
406 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.54 
 
 
254 aa  50.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  36.61 
 
 
240 aa  50.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
383 aa  50.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  31.29 
 
 
425 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.87 
 
 
248 aa  50.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
1314 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2593  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.09 
 
 
406 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.604704  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
810 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  28.74 
 
 
322 aa  50.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 
257 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2617  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.09 
 
 
406 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.92 
 
 
232 aa  49.7  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  31.17 
 
 
217 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  30.67 
 
 
211 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 
248 aa  49.3  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.08 
 
 
343 aa  49.3  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  29.37 
 
 
304 aa  49.3  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  29.29 
 
 
311 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
332 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  29.7 
 
 
230 aa  48.5  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  30.72 
 
 
309 aa  48.9  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
310 aa  48.5  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.4 
 
 
258 aa  48.5  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
196 aa  48.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0957  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.47 
 
 
378 aa  48.1  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.54 
 
 
253 aa  48.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  28.28 
 
 
298 aa  48.1  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
317 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
205 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  29.94 
 
 
330 aa  48.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  25.94 
 
 
237 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  31.94 
 
 
323 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  31.21 
 
 
213 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  31.39 
 
 
258 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 
252 aa  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2488  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.34 
 
 
406 aa  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697933  normal  0.406612 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>