More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6705 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  100 
 
 
810 aa  1672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4478  hypothetical protein  24.86 
 
 
626 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297343  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0887  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
1350 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
369 aa  87.4  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
401 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
1106 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
359 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
208 aa  73.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  32.53 
 
 
254 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
634 aa  72.4  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
1032 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  29 
 
 
317 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
239 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2639  hypothetical protein  32.89 
 
 
318 aa  64.3  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
194 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
237 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  29.73 
 
 
219 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2788  hypothetical protein  29.74 
 
 
310 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00705384  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
689 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.05 
 
 
258 aa  62.4  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  29.53 
 
 
263 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  32.73 
 
 
400 aa  61.6  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
261 aa  61.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
688 aa  60.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
248 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  28.89 
 
 
687 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.32 
 
 
220 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
248 aa  60.1  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
266 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
264 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35 
 
 
225 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
259 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  26.97 
 
 
885 aa  59.3  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
290 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32.35 
 
 
226 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
255 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  29.32 
 
 
274 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
265 aa  58.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.92 
 
 
230 aa  58.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
246 aa  58.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.81 
 
 
270 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
208 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
206 aa  57.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  32.35 
 
 
226 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
255 aa  57.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0931  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
262 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
262 aa  57.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4288  hypothetical protein  37.93 
 
 
247 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  32.35 
 
 
199 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 
206 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
273 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  29.13 
 
 
240 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.91 
 
 
263 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
210 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30 
 
 
226 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
411 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
226 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
178 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
285 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
261 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
265 aa  56.6  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.03 
 
 
270 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
624 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  33.67 
 
 
217 aa  55.5  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 
242 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
225 aa  55.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
281 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
272 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  33.67 
 
 
217 aa  55.5  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
711 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
238 aa  55.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
207 aa  55.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
710 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
246 aa  55.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
251 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5458  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 
337 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  31.3 
 
 
268 aa  54.3  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
239 aa  54.3  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
299 aa  54.3  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  29.58 
 
 
1124 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
216 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  32.35 
 
 
236 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  32.35 
 
 
236 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.71 
 
 
273 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
293 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
237 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
286 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
252 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0609  methyltransferase type 11  30 
 
 
221 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304159  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
246 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  32.35 
 
 
236 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
706 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 
238 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
698 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
246 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
260 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.17 
 
 
235 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>