90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0420 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  33 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  31.63 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  32.17 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  31.96 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.67 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  26.11 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.57 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.86 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  24.67 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.89 
 
 		 672 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  27.18 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.91 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  23.91 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  23.79 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  29.73 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  31.61 
 
 		 1046 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  27.71 
 
 		 574 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.71 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  25.19 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  24.22 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  27.04 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  38.68 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.98 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  22.84 
 
 		 513 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  28.95 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.99 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  24.8 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  27.82 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  22.36 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  21.52 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1206  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.65 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  27.39 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.03 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.11 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  22.47 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  30.46 
 
 		 241 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  22.71 
 
 		 406 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  23.98 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  25 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.67 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  26.2 
 
 		 620 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  23.4 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  25 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  22.36 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 625 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  26.74 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 1037 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 572 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  26.49 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  24.39 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  22.31 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  26.05 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  25.41 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.57 
 
 		 391 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  23.25 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 248 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.35 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  36.79 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  22.75 
 
 		 383 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>