109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3735 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 334 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.89 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.37 
 
 		 672 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.62 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  29.44 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  23.66 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.1 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  24 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  30.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  30.43 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.02 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.77 
 
 		 277 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.3 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  24.89 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  24.81 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.15 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  24.79 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  24.38 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 1177 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  24.8 
 
 		 625 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 1177 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  23.83 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  30.25 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  23.65 
 
 		 240 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.21 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  25.4 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24.21 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  22.94 
 
 		 223 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  26.12 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 457 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.4 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  22.54 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  23.79 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  28.44 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  25.58 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  24.89 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.55 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  24.57 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  22.69 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  25.12 
 
 		 281 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  23.58 
 
 		 217 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  22.47 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  23.84 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  21.93 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  19.91 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 1340 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  23.41 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  23.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  24.49 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  20.93 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  30 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 572 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  21.2 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  21.2 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  21.95 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  26.76 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  22 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 996 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  22.27 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 		 1523 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  21.5 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 299 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.98 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  23.53 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  19.15 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 249 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  21.97 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>