70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2204 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  100 
 
 
304 aa  634    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  28.29 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  27.57 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  27.84 
 
 
318 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  24.36 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  29.51 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  25.44 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  28.19 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.14 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  23.62 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  23.91 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.97 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  23.43 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.22 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  25.69 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  30.53 
 
 
263 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  22.73 
 
 
305 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  24.24 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  21.74 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  23.4 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
214 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.37 
 
 
415 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  29.52 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.64 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.62 
 
 
353 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
353 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.86 
 
 
672 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  30.39 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  20.87 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.85 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.82 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
1314 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
244 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2223  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.64 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399173  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  30.26 
 
 
217 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 
853 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  32.69 
 
 
217 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
1312 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  32.14 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.14 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
572 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
1523 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  24.44 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  32 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
1340 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  31.71 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.94 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  25.65 
 
 
543 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
996 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  22.52 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.29 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12801  hypothetical protein  22.83 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.838428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  32.69 
 
 
237 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  23.35 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  25.88 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
1177 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  33 
 
 
336 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>