248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1187 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  82.41 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  83.8 
 
 		 222 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  78.64 
 
 		 231 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  78.64 
 
 		 222 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  77.27 
 
 		 231 aa  354  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  75.45 
 
 		 230 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  70 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  68.5 
 
 		 220 aa  291  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  65.52 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  65.67 
 
 		 229 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  65.67 
 
 		 229 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  69.54 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  68.16 
 
 		 215 aa  276  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  66.5 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  65.99 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  58.54 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  58.45 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  52.53 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  52.74 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  50 
 
 		 195 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  52.22 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  48.99 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  46.89 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  45.92 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  43.22 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  43.35 
 
 		 202 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  42.93 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  46.75 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  48.28 
 
 		 197 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  43.01 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  42 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  41.84 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  40 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  42.86 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  42.5 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  40.31 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  43.5 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  41.33 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  40.8 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  40.82 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  39.29 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  39.29 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  41.41 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  41.92 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  41.84 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  41.92 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  41.84 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  41.58 
 
 		 203 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  40.91 
 
 		 200 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  42.44 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  37.07 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  35.29 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  41.24 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  41.36 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  43.1 
 
 		 203 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  43.1 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  41.86 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  41.79 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  41.79 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  41.79 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  41.79 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  41.79 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  41.79 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  41.94 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  36.82 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  41.71 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  41.92 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  41.18 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  43.01 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  42.47 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  42.47 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  42.47 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  42.47 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  42.47 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  42.47 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  42.47 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  36.32 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  44 
 
 		 194 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  41.29 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  41.4 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  40.86 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  40.86 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  40.61 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  43.98 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  41.18 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  39.06 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  39.57 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  39.57 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  42.17 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  38.74 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  36.75 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  36.97 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 1287 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1085 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  35.63 
 
 		 488 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  30.1 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  26.47 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>