More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6087 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 2112 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 1312 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  36.04 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.03 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.85 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.93 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.81 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 1314 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.38 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.85 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.04 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  34.19 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  26.02 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.14 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.25 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862077  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  25.41 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  23.98 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.24 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  24.19 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.69 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  23.98 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  35.11 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.64 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  31.48 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.64 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  25.91 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  23.53 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.85 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 1287 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.9 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.67 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.26 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.33 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  30 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  23.98 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  36.63 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  23.53 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.86 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.24 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.18 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.23 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0575  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.37 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  35.58 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.41 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.23 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  26.92 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  23.08 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  24.34 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  25.64 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  26.15 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.38 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.6 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  23.08 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  23.08 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.77 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.13 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.3 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.3 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  25.64 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.53 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  25.64 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.91 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  25.64 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  25.64 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  30.84 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  25.26 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.2 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.83 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  25.64 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  25.64 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  24.61 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>