More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3803 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 300 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  47.65 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  44.44 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  45.32 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  44.13 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  40.13 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  40.86 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  30.87 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  32.15 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 		 358 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  27.3 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.27 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.44 
 
 		 672 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  28.76 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  29.06 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 346 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  29.08 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.59 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.09 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  26.44 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  24.39 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.89 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 1177 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 1177 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 214 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  25.1 
 
 		 607 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  26.91 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  26.91 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.91 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.9 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  29.96 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 625 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.91 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.07 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  23.31 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.29 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.12 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  25.81 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.52 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  24.53 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  21.88 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.53 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  21.66 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 1037 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  23.95 
 
 		 620 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  24.85 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  27 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1124 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  22.75 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  22.38 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.81 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0386  hypothetical protein  21.8 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.669351  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.05 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  20.19 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  29.86 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  24.6 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 1046 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  24.07 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 1162 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  25 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  31.36 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>