91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp3019 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  634    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  46.77 
 
 
442 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  47.54 
 
 
442 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  42.57 
 
 
436 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 
396 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  44.49 
 
 
646 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  45.9 
 
 
272 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  45.9 
 
 
272 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  41.77 
 
 
1635 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  43.89 
 
 
477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  35.85 
 
 
373 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  41.53 
 
 
351 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  31.88 
 
 
417 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  29.82 
 
 
1085 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  28.32 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
995 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  33.67 
 
 
353 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
353 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.36 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
282 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.38 
 
 
358 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  34.31 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.05 
 
 
345 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
222 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
226 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.93 
 
 
672 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
211 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  24.82 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
247 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
255 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
248 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
214 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.46 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
1162 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  24.2 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.37 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  24.6 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.48 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  26.67 
 
 
488 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  27.59 
 
 
185 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
210 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
222 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  27.21 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  28.44 
 
 
222 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  34.78 
 
 
172 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
551 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
178 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
191 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  27.34 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
207 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.45 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.18 
 
 
332 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
226 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
244 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  24.83 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.71 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  28.85 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  26.77 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.21 
 
 
434 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  34.18 
 
 
197 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
245 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  24.03 
 
 
220 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  32.99 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  25 
 
 
419 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  27.03 
 
 
354 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.08 
 
 
233 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  28 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30 
 
 
271 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  29.27 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  26 
 
 
219 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  24.73 
 
 
245 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
252 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1457  hypothetical protein  24.19 
 
 
238 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  24.44 
 
 
242 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>