More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4080 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 306 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  31.51 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.16 
 
 		 672 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.07 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.66 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.4 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.56 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.98 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  22.54 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  24.27 
 
 		 876 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  20.7 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  24.89 
 
 		 607 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  24.64 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  23.62 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  23.62 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.64 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.12 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  26.7 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1094 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  29.71 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 572 aa  63.5  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  25.15 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  27.66 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  20.19 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  25.14 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  27.11 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  31.69 
 
 		 1046 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  24.26 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  25.43 
 
 		 625 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  23.72 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  23.72 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.74 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.85 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.85 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  23.03 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 1037 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  24.5 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  20.08 
 
 		 346 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  27.67 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.87 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.39 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  24.27 
 
 		 620 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  21.65 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 1162 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  20.11 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  22.16 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  22.12 
 
 		 354 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  20.95 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0339  hypothetical protein  26.16 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0688998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  25 
 
 		 613 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.64 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  24.68 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  22.62 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  23.21 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  18.3 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.66 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.51 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  23.94 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  24.68 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>