More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3138 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 263 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  38.36 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 634 aa  85.5  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  36.65 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  37.24 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.29 
 
 		 400 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.28 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 885 aa  70.1  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 		 1106 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 1032 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  29.59 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  34.17 
 
 		 646 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  29.75 
 
 		 870 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.61 
 
 		 345 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  27.86 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  27.86 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  27.86 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  27.23 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.47 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.61 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.25 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.86 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.5 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.5 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.79 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  33.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.25 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 810 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.19 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  30.13 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  30.13 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  30.13 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.73 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.62 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.77 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.2 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  34 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  34 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.75 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  30.84 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.57 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.89 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>