More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0390 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  36.07 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.52 
 
 
214 aa  104  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  32.77 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  45.54 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 
265 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.04 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
1032 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  45.54 
 
 
268 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  43.01 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1255  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.97 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.16 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  34.29 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  43.56 
 
 
487 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  42.34 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  34.36 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 
272 aa  71.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 
225 aa  71.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.64 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
710 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04683  methyltransferase  40.34 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771999  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  38 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  38.46 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.86 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  42.06 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  36.52 
 
 
231 aa  67.8  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  44 
 
 
265 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
262 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  35.83 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.45 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  33.57 
 
 
287 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  34.51 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  38 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 
711 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 
457 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.12 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  37.86 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
301 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  41.76 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0141  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
233 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  39.78 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 
255 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.57 
 
 
254 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
810 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
254 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.43 
 
 
296 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.36 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.94 
 
 
272 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  34.45 
 
 
414 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  40 
 
 
311 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 
273 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.53 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  32.75 
 
 
2112 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
266 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  41.12 
 
 
276 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
229 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.96 
 
 
258 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
267 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  39 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>