More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0636 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  100 
 
 
275 aa  568  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04683  methyltransferase  74.5 
 
 
239 aa  228  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  35.74 
 
 
273 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
270 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.95 
 
 
267 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.99 
 
 
268 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.66 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.11 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32.51 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.05 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  26.1 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.04 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.4 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.71 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
202 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.14 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.68 
 
 
205 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.85 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.79 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.21 
 
 
238 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.41 
 
 
213 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.04 
 
 
217 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 
234 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
282 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
187 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.75 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.68 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.88 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.96 
 
 
245 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.86 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.56 
 
 
392 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  29.34 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  30.47 
 
 
351 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.32 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
201 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
1012 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
212 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.09 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.86 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.96 
 
 
218 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
220 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.73 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  32.74 
 
 
256 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  37.5 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31 
 
 
221 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  27.5 
 
 
351 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  24.23 
 
 
217 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
227 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.86 
 
 
236 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.28 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.51 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  29.6 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
204 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>