More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04683 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04683  methyltransferase  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  74.5 
 
 		 275 aa  228  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  39.72 
 
 		 273 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 281 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 267 aa  85.5  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  33.56 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  40.34 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.94 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.82 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.38 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.04 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.86 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.91 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.91 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  33.01 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.62 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.62 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 284 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.17 
 
 		 354 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 349 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.4 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.45 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.83 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 279 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.18 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  33.93 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 327 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  28.81 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 624 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.77 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 339 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.19 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.86 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.99 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  34.75 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.03 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 328 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.89 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.06 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.61 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>