More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0628 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  64.53 
 
 
268 aa  352  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  63.67 
 
 
267 aa  346  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  62.93 
 
 
270 aa  345  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  61.05 
 
 
268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  59.7 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  52.24 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30 
 
 
281 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
268 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
268 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04683  methyltransferase  38.03 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
265 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
283 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  33.77 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.72 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.27 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.45 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  32.24 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  29.02 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  26.84 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  28.76 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.84 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.84 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.96 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
355 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  35.59 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  27.75 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.09 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.6 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.26 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  39.6 
 
 
631 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.22 
 
 
211 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  38 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  26.01 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  35.45 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.89 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  31.53 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.24 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1269  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.54 
 
 
341 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.62 
 
 
402 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  30.89 
 
 
535 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  28.3 
 
 
335 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.89 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.34 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35 
 
 
215 aa  62  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.7 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.06 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.89 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.89 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.01 
 
 
414 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
402 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
390 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.63 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  28.5 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>