More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0322 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  100 
 
 
268 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  61.05 
 
 
268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  58.62 
 
 
270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  56.27 
 
 
268 aa  308  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  56.55 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  52.83 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  54.31 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.21 
 
 
281 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04683  methyltransferase  37.62 
 
 
239 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
265 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.32 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
285 aa  95.5  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.42 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  31.95 
 
 
313 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  29.49 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.91 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  34.38 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.97 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.44 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  45.54 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  29.02 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  26.77 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  27.47 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.52 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  35 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  42.72 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.19 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.53 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.64 
 
 
447 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  29.44 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.59 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  36.94 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.39 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  28.76 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.38 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30.68 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.45 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.74 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.97 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.6 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  35.85 
 
 
414 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.79 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  30 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.74 
 
 
218 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  32.63 
 
 
204 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.65 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  37.17 
 
 
168 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32.1 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  31.17 
 
 
293 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.85 
 
 
200 aa  62.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.19 
 
 
218 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.1 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.96 
 
 
293 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
220 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
273 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.51 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.08 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.18 
 
 
355 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.94 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  36.79 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36.03 
 
 
354 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>