More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0484 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  100 
 
 
240 aa  500  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  47.26 
 
 
241 aa  234  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  43.88 
 
 
241 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  48.1 
 
 
239 aa  228  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  44.73 
 
 
241 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  46.84 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  47.3 
 
 
238 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  44.35 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  44.87 
 
 
289 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  46.84 
 
 
243 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  46.84 
 
 
243 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  46.84 
 
 
243 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  43.46 
 
 
255 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
237 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  45.57 
 
 
238 aa  214  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  41.25 
 
 
243 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  41.77 
 
 
237 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  40.08 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
239 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
249 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  40.25 
 
 
222 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  40 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.38 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
711 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  32.65 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.39 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 
710 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
293 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  43.36 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.5 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.85 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.89 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  33.56 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  27.23 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.91 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  28.04 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  24.69 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.2 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  24.47 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  37.61 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
1012 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  27.42 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 
382 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.52 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.43 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1966  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.6 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.74 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.6 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  33.63 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  34.36 
 
 
309 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.3 
 
 
213 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
278 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.63 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.46 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>