More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2082 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  61.83 
 
 
270 aa  329  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  62.6 
 
 
269 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  58.02 
 
 
264 aa  289  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  53.44 
 
 
272 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  53.05 
 
 
271 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  54.17 
 
 
272 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  55.3 
 
 
275 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  52.29 
 
 
283 aa  275  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  55.94 
 
 
273 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  50.19 
 
 
267 aa  254  8e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  48.11 
 
 
270 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  46.77 
 
 
285 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  48.86 
 
 
296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50.38 
 
 
272 aa  242  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  45.91 
 
 
313 aa  221  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.72 
 
 
275 aa  149  5e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
273 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
268 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
268 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
268 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  30.18 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.14 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
268 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
268 aa  89  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  28.09 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  43.97 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  44.14 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  40.85 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  35.42 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  40.52 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.28 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.71 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.71 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.71 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 
194 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  36.53 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  44.55 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  40.14 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.82 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  45.95 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  37.86 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  30.13 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  44.27 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  42.98 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  29.55 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  28 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.89 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.04 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.67 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.74 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  42.73 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  36.89 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.42 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.69 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.94 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 
634 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  29.02 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  39.64 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  35.56 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.97 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.06 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.97 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.05 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  25.73 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  39.32 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.4 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  44.76 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.6 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>