More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3543 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 335 aa  653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  76.04 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  57.01 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  56.92 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  50.93 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  55.66 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  56.87 
 
 		 354 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  52.44 
 
 		 328 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  51.78 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  49.69 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  49.53 
 
 		 341 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  50 
 
 		 340 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  53.75 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  49.84 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  38.08 
 
 		 309 aa  169  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.98 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  35.56 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  35.86 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  33.45 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.98 
 
 		 307 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  39.72 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  30.5 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  36.24 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  34.62 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.6 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  30.31 
 
 		 331 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 206 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.8 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  28.78 
 
 		 206 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.26 
 
 		 207 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.99 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.54 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.85 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  42.4 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.55 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.38 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  36.11 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.84 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.71 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.75 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  36.36 
 
 		 629 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>