More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  98.48 
 
 		 329 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  79.57 
 
 		 331 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  75.91 
 
 		 331 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  76.22 
 
 		 331 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  77.71 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  76.23 
 
 		 336 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  74.09 
 
 		 330 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  49.54 
 
 		 333 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.85 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.06 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.72 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  34.71 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.69 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.8 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  31.27 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 349 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.95 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  38.2 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  30 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  30.67 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 207 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  30.24 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  32.39 
 
 		 206 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.59 
 
 		 207 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  35.03 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  35.39 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.09 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 212 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.33 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  48.53 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  48.53 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.89 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 124 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  26.35 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  40.28 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.42 
 
 		 119 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  35.35 
 
 		 123 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  38.36 
 
 		 125 aa  57  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 		 125 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>